熊本城は西向きの城郭になっています。曲輪（くるわ）の構成は地形的に低い西側に登城口があり、次第に高くなっている東側になるに従って主要な曲輪が配置されました。そこで天守をはじめとする本丸の建物は城域の東端付近に位置しています。これは築城される前段階の丘陵・茶臼山の地形に起因するものと考えられます。
　城郭に入る城門は各方向にありましたが、正面にあたるのは新町方向の新一丁目門でした。ここは城域の裾（すそ）に水堀がめぐる部分で、門の入り口が地続きの陸橋となっていました。加藤時代には屋根付門だけで守られていましたが、細川氏入国後に模型の写真のように櫓（やぐら）門が付設され厳重さを増したことが絵図で知られます。その場所は宮内にある現在の清爽園（せいそうえん）内で、庭造りされている池の部分からその北側にありましたが、今ではほとんど痕（こん）跡も残っていません。
　新一丁目門を入ると道が折れ曲がりながら北に登っていました。この坂は法華坂と呼ばれ、坂の脇に加藤清正が大坂から本妙寺を移したことによると伝えています。坂道の北端には住江門があり、二ノ丸の重臣屋敷に通じていました。これから西大手門を入り、頬当門から数寄屋丸門を進むと本丸に至りました。
　門の前（南・新町側）は「勢屯（せいだまり）」（広場）となり人々の集まる場でもありました。そこには藩のお触れ（高札（こうさつ））の掲示場所があり「札ノ辻（ふだのつじ）」と呼ばれました。熊本から各方向に街道が通じていましたが、その基点となったのがこの「札ノ辻」でした。北への豊前街道と東へ向かう豊後街道は前に述べた城内の法華坂から二ノ丸門を通り京町に出ていました。南への薩摩街道と東南への日向街道は新町を通り長六橋で白川を渡っていました。この基点から一里ごとに目印のエノキが植えられ、今でも街道沿いには一里木・二里木・三里木というバス停や駅名として生きています。